Nachdem man den Heiligen Stein des Wassers von Ruto erhalten hat, sagst sie, dass man nun Prinzessin Zelda aufsuchen muss. Dazu begibt man sich nach Hyrule. Dort angekommen, wird Link´s Traum Realität. Die Zugbrücke öffnet sich, und Zelda wird von Impa aus dem Schloss gebracht. Dabei wirft sie einen Gegenstand zu Link, der im Schlossgraben landet. Link dreht sich um und trifft auf Ganondorf. Allerdings hat man noch keine Chance, gegen ihn zu kämpfen. Nachdem er fortgeritten ist, springt man in den Burggraben und taucht nach dem Gegenstand. 

Nun findet man sich in der Halle der Weisen wieder und spricht mit Rauru, einem der sieben Weisen. Dieser erzählt, dass man die Kräfte aller sieben Weisen freisetzen muss, dafür muss man sich in die fünf Tempel begeben. Ausserdem erklärt er, warum man sieben Jahre älter geworden ist. Danach übergibt er das Amulett des Lichtes. 
Man findet sich in der Zitadelle der Zeit wieder. Dort trifft man auf Shiek. Dieser stellt sich als einer der letzten Überlebenden der Shieka vor und sagt, dass man sich zum Waldtempel begeben muss, um den ersten Weisen zu befreien, ein Mädchen, dass man gut kennt. Allerdings braucht man vorher noch einen Ausrüstungsgegenstand, wofür man sich nach Kakariko begeben soll.